經過10多年的技術改進，水墨體系已成功解決了大多數原先存在的難點，如難以使用、油墨的儲存、基材的局限性以及電暈處理和表面張力等問題。但目前水性油墨仍然有部分技術問題尚未解決，妨礙其進一步擴大應用。
干燥時間仍是水墨應用中最重要的問題，除非印刷機配備足夠的干燥設備，否則印刷速度因之而受影響。另外，由于水墨溶于堿性溶液，使得水墨在高磁性環境中應用受到限制，水墨在冷凍食品包裝上的應用仍不具有溶劑墨的耐性，盡管距離在快速縮短，但由于水墨中水組分的高表面自由能使得水墨在許多基材上難以很好地潤濕和印刷。
環保型水性油墨目前最主要的應用領域是柔性版印刷與凹版印刷，美國95％的柔性版印刷品和 80％的凹版印刷品采用水墨。柔性版印刷在中國尚處于起步階段，目前僅占印刷領域的3％左右。
